Cada depósito é dividido em setores. Um setor é utilizado basicamente para separar produtos que não devem ser armazenados ou transportados juntos, por correr o risco de contaminar os alimentos.
O sistema ao ser iniciado já terá um setor para o depósito principal por padrão, mas conforme a necessidade do centro de distribuição, ao menos mais um setor deverá ser criado.
Um exemplo de produtos que devem estar em setores diferentes, são:
•Farinha de trigo e água sanitária.
•Arroz e solventes
NOTA: Não criem muitos setores para não engessar desnecessariamente os processos do depósito.