Acesso o cadastro do produto (Estoque -> Produto -> Manutenção) e defina uma Figura NCM configurada com isenção de PIS/COFINS.

Outra alternativa é alterar a própria Figura NCM do produto. Para isso, faça o seguinte:

•Pressione '+' no campo figura NCM, para abrir a Consulta Figura NCM;

•Informe o número do NCM e clique Aplicar;        

•Com o registro selecionado, clique Alterar, para iniciar o Cadastro Figura NCM;

•Na aba "Saída", campo "CST do PIS/COFINS",  informe 07; no campo "Natureza da receita" informe 999, 

•Na aba "Entrada", campo "CST do PIS/COFINS", informe 70;

•Clique Gravar.

A imagem abaixo ilustra estes passos: